单细胞测序代表了基因组学的范式转变,为了解细胞行为和功能的复杂性提供了前所未有的见解。这一快速发展的领域取决于分析单个细胞的能力,揭示大量测序方法无法发现的异质性和稀有细胞群。单细胞测序的准确性关键取决于样本制备的质量,这就强调了测序前精确细胞计数和样本评估的重要性。
单细胞核的质量在单细胞基因组学中至关重要,因为它直接影响测序数据的可靠性和准确性。高质量的细胞核样本可确保获得的遗传信息具有代表性,并且不会出现可能导致结果偏差的伪影。本节将深入探讨制备高质量细胞核样本所面临的挑战和涉及的技术,重点说明为什么细致的制备对单细胞测序的成功至关重要。
自动细胞计数技术(如 LUNA-FX7™ 自动细胞计数仪)的进步简化了细胞核质量评估过程。这些先进的设备利用荧光染料和成像工具对细胞核质量进行准确、可靠的测量。
LUNA-FX7™ 等自动细胞计数仪是一种先进的仪器,具有强大的综合分析能力。这些系统可无缝捕捉明场和荧光图像,然后使用荧光信号进行分析以获得有价值的数据,例如细胞大小、活力和细胞计数。
要评估分离细胞核的质量,可以利用这些系统提供的平均细胞大小数据。例如,与完整细胞相比,去除了细胞膜的细胞核的尺寸要小得多。这是因为去除细胞膜和细胞质会导致细胞尺寸缩小几微米。特别是,LUNA-FX7™ 从明场图像中提取细胞大小信息。因此,由于荧光图像计算可能伴随的荧光强度,细胞尺寸的失真最小。这确保了在评估分离细胞核的质量时,细胞大小测量更加可靠。
使用荧光染料评估细胞核质量的另一个有用数据是细胞存活率。如图 1 中的结果所示,与 AO/PI 或 AO/EthD-1 结合使用时,健康完整的细胞显示出接近 100% 的细胞活力。相反,分离良好的细胞核显示出接近 0% 的细胞活力。值得注意的是,LUNA-FX7™ 等自动细胞计数仪在使用这些染料染色时能准确量化分离的细胞核细胞浓度。
总之,在单细胞基因组学中整合自动细胞计数技术改变了游戏规则,提高了研究结果的准确性和可靠性。LUNA-FX7™ 自动细胞计数仪体现了这一进步,为研究人员提供了评估细胞核样本质量的强大工具。随着基因组学领域的不断发展,此类技术创新仍将是推动我们了解细胞世界的关键。
荧光染料和自动细胞计数仪:在单细胞基因组学中实现可靠的细胞核质量。 https://logosbio.com/application_notes/fluorescent-dyes-and-automated-cell-counters-towards-reliable-nuclei-quality-in-single-cell-genomics//
有关 LUNA-FX7™ 自动细胞计数仪的更多信息,请访问 https://logosbio.com.cn/luna-fx7/。